2024IGEM-SWUER

研究员助理你好！

我们是来自2024西南大学科研中心的 iGEM-SWUer 们，末世已经到来人类的安全危在旦夕研究员助理们，让我们一起执着追求，永不停歇，拯救世界！！

未来就看你的了

你好！亲爱的研究员助理请问你做好准备与我们同行了吗？

当然！let‘s start it~

hah 不准反悔！和我们一起拯救世界叭！

亲爱的研究员助理您的年龄范围是:

18岁以下

18-30岁

31-45岁

46-60岁

60岁以上

亲爱的研究员助理您目前处于（）学历水平:

初/高中毕业

大专/职业学校

本科学历

研究生学历

博士学历

亲爱的研究员助理不知道你对这个世界的现状是否了解呢？

1-1 这个世界有好多好多真菌敌人，请问你曾与哪些真菌敌人奋力作战过呢？

【多选题】

（辨别下列哪些是真菌呢）

大肠杆菌

白色念珠菌

霍乱弧菌

链球菌

霉菌

1-2 研究员助理你知道这个世界上有多少种真菌敌人吗？【多选题】

50多种

200多种

400多种

600多种

我不知道))抱歉...

2-1.你/你身边的人是否被可恶的真菌感染过呢（藓...）

有！！

没有过哎

我不知道哎

2-2. 你/你身边的人都是如何与真菌敌人奋力斗争的呢?

等待自愈

使用抗生素药物

其他治疗手段

2-3. 你如何看待抗生素药物治疗呢?

对症下药必须之措

能不用就不用可能会产生抗药性

3. 研究员助理您是否听说过/合成抗菌肽这种消灭细/真菌敌人的新型武器呢?

听过

没听过

没关系让我们再了解一下这种消灭细/真菌的新型“武器”-抗菌肽吧~

4-1没错此前人们过于信任抗生素，导致抗微生物药物耐药性威胁加剧，并使现代医学的许多成果面临风险。而后抗生素时代，AMPs（antimicrobial peptide）由于其潜在的治疗作用，近年来受到了人们的广泛关注。以您目前的理论知识基础，你是否觉得AMPs有潜在发展前景呢?

是，可很好解决抗生素抗药性

否，抗生素无法被代替

4-2 就白色念珠菌来看，目前临床上，以服用氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊等唑类药物治疗，从而起到抗真菌的效果。您是否认为目前的治疗方法对于白色念珠菌引起的疾病足够有效?

是的对症下药

唑类药物已逐渐对白色念珠菌失去作用

医生开啥我吃啥

4-3.是的当细菌病真菌和寄生虫不再对药物产生反应，即出现了抗微生物药物耐药性。这会使人们病情更加严重，疾病传播、发病和死亡的风险增加。研究员助理错误和过度使用抗生素药物将会造成【多选题】

毒副反应

耐药病原

二重感染

交叉感染

免疫力低下

4-4您对于使用合成抗菌肽治疗可能出现的副作用有何担忧?

亲爱的研究员相信你已经对这个真菌席卷的世界有所了解恭喜你已经通过基础考核

欢迎来到研究中心核心区。

接下来，这里有更重要的任务等着你！！

但是否接受取决于你

亲爱的研究员是否接受这项任务取决于你这项任务可能会消耗一些时间与精力

下列问题涉及一些浅层生物信息/深度学习知识相信你在作答时一定会受益匪浅但如果你是与生物领域毫不相干/对生信毫无兴趣请选择“否终止行动” 同时由衷感谢你陪我们走到这里

是继续前行

否终止行动

目前除了从不同生物中提取天然AMP外，为获得更高效且作用更显著的AMP以及抗真菌多肽AFPs,我们可以采用深度学习(deep learning)的方式加速发现抗真菌肽，你是否知道深度学习是什么?

是

否

深度学习是...

本研究中心正以一种新型的模型来筛选具有较高效的抗菌多肽攻克抗生素耐药性这一难题，主要是由新的预训练语言模型DeBERTaV3以及可直接从蛋白质序列推断出完整的原子级蛋白质结构的大型语言模型ESM-2模型构成，流程图如下。您认为正确的思路顺序是：

【排序题】

输入蛋白序列
返回到蛋白序列的预测得分和预测结果，同时实现两个功能
推算出具有代表性的真菌的最小抑菌浓度值
判断抗菌多肽

上述流程图中的最小抑菌浓度（minimal inhibitory concentration,MIC）和最小杀菌浓度（minimum bactericidal concentration,MBC），单位以μg/ml或mg/L来表示。使用抗感染药治疗的最终目的是根除人体被感染部位的病原微生物，从微生物学角度看是通过达到和维持一定的抗感染药的浓度来实现的。

因此，研究员，你觉得抗感染药在体内或体外的浓度要MIC，才能病原微生物的生长；浓度要MBC，才能病原微生物。

填空内容为：达到或超过/小于或低于；抑制/促进/杀灭；达到或超过/小于或低于；抑制/促进/杀灭

智脑菲克斯设计三种分析模型如下图所示，请研究员仔细判别，选择一种功能更好的模型

模型一（仅能鉴定抗菌肽）：